Man schreibt das Jahr 2670. Nach einer Revolte intelligenter, durch die Menschen versklavter Affen, ist die Erde durch einen Atomkrieg verwüstet worden. Das friedliche Zusammenleben von Menschen und Affen wird durch eine Gruppe militanter Gorillas und radioaktiv verstrahlter
menschlicher Mutanten gestört.
Die neue Gesellschaft wird von den Affen beherrscht. Ihr Anführer ist Caesar, ein ungewöhnlich kluger und charaktervoller Schimpanse. Caesar erfährt, dass in den Ruinen einer Stadt ein Interview mit seinen verstorbenen Eltern existieren soll, die den Menschen einst ihre Zukunft prophezeiten. Zusammen mit Virgil und Mac Donald macht er sich auf, das Tonband zu suchen.
In der Ruinenstadt stoßen sie aber auch auf menschliche Wesen, die durch die Auswirkungen der atomaren Katastrophe entstellt sind. Caesar und seine Begleiter können gerade noch dem früheren Affen-Sklavenaufseher Kolp entkommen, als plötzlich Gorilla-General Aldo zum Kampf gegen die friedliebenden Schimpansen aufruft.
Jetzt ruht die ganze Hoffnung auf Caesar, dem Anführer der Affen. Seine große Herausforderung ist es, die harmonische Gemeinschaft vor der endgültigen Vernichtung zu retten...