In einem gespenstischen Labor arbeitet eine Gruppe von Wissenschaftlern daran, das mächtigste Pokémon der Welt zu erschaffen.Der genetische Code eines fossilen Haares des geheimnisvollen Pokémon "Mew" bildet die Basis des Experiments.
Und es gelingt: Mews genetische Kopie, der Klon "Mewtu", in dem ungeheure Kräfte schlummern, ist entstanden. Mewtu fühlt sich als Versuchskaninchen und als Neo-Frankenstein missbraucht.
Die erste Demonstration seiner Macht wird seinen Schöpfern zum Verhängnis: das Forschungslabor fliegt in die Luft. Bald danach tritt ein undurchsichtiger Mann an Mewtu heran, der ihm angeblich weiterhelfen will. Der dubiose Freund verspricht ihm, in als Partner zu akzeptieren und ihm die Herrschaft über alle übrigen Pokémon zu verschaffen.
Doch der Fremde spielt sich immer mehr als "Meister" auf. Mewtu lässt seiner Enttäuschung an dem verschlagenen Ratgeber freien Lauf, zerstört dessen Festung und nimmt sich vor, nicht nur die Menschen, sondern auch alle Pokémon zu beherrschen.
Zum Glück gibt es Ash Ketchum und dessen Freunde Misty und Rocko, ihres Zeichens Pokémon-Trainer.
Und da gibt es natürlich auch noch jede Menge Pokémon, die nicht einfach so von irgendwem beherrscht werden wollen...
