Nur die Besten der Besten dürfen sie besuchen: Die Sky High ist eine Elite-Lehranstalt für ganz besondere Schüler. Hier werden die Superhelden von morgen ausgebildet, und für die Kids mit den übermenschlichen Kräften stehen neben Mathe und Geschichte auch Trainieren der eigenen Superkräfte, Verbrechensbekämpfung und Weltretten auf dem Lehrplan.
Auch Will, der Sohn von Steve und Josie Stronghold besucht neuerdings die Sky High. Allerdings hat er keinen leichten Stand – schließlich ist er der Sprössling der berühmtesten Superhelden der Welt: Als The Commander und Jetstream sind seine Eltern unschlagbar. Da hängen die Erwartungen hoch. Und als Will beim Einschulungstest keinerlei Superkräften präsentieren kann und folgerichtig nicht der Klasse der "Helden" zugeteilt, sondern nur als "Heldenhelfer" – den ruhmlosen Assistenten der Superhelden – eingestuft wird, muss er nicht nur mit der Enttäuschung seiner Eltern, sondern auch mit dem Spott seiner Mitschüler leben. Insbesondere der rebellische Warren Peace und sein Sportlehrer Coach Boomer scheinen es auf ihn abgesehen zu haben. Wie gut, dass Superheldin Gwen Grayson ein Auge auf Will hat – sehr zum Missfallen seiner Sidekick-Schulfreundin Layla, die schon seit der Grundschule heimlich in Will verliebt ist.
Ob Superheld oder Heldenhelfer – alle Schüler freuen sich auf den großen Schulball, zu dem auch Wills Eltern als Ehrengäste eingeladen sind. Doch der Abend verläuft anders, als geplant: Royal Pain, der einstige Erzfeind des Commanders taucht auf und bedroht alle mit einer heimtückischen Superwaffe. Wenn Will Schlimmeres verhindern möchte, wäre es jetzt an der Zeit, seine kürzlich entdeckten Superkräfte einzusetzen. Jetzt liegt es allein an ihm zu beweisen, dass er durchaus der Sohn seiner heldenhaften Eltern ist...